• יו"ר: פרופ' יוחאי אדיר
  • מזכיר ונציג ישראל ב-ERS: ד"ר אמיר בר שי
  • גזברית: ד"ר דניאל בן דיין
  • חברת ועד, עורכת האתר: ד"ר מיכל שטיינברג
  • חבר ועד: ד"ר דרור רוזנגרטן
מחקרים

אילו גנים קשורים לנטייה לאסתמה?

במחקר חדש איששו החוקרים כי גן ה-HLA קשור למחלות אטופיות, וזיהו פרופיל גנטי הקשור לרמת ה-IgE בסרום וכן לוקוס חדש הקשור לתפקוד הריאתי

גנים (צילום: אילוסטרציה)
גנים (צילום: אילוסטרציה)

במחלת האסתמה ישנם פערים בריאותיים בין מטופלים, הנגרמים עקב שונות גנטית. מחקר שפורסם בכתב העת The Journal of Allergy and Clinical Immunology נערך במטרה לבחון את ההשפעה של המוצא הגנטי על אסתמה, ולזהות וריאנטים גנטיים הקשורים למחלה, לרמת ה- IgE הכוללת בסרום ולתפקודי הריאות.

במסגרת המחקר זוהה הגנוטיפ של 436 ילדים (בני 9-19 שנים) מפרו שסבלו מאסתמה ו-291 ילדים ללא אסתמה, תוך שימוש ב-Illumina Multi-Ethnic Global Array.

לצורך הערכה רוחבית של הגנום, עשו החוקרים שימוש במזיגה (ADMIXTURE) שבעזרתה חושבה הפרופורציה של אוכלוסיות שמוצאן מילידים של יבשת אמריקה (NAT) ושל אוכלוסיות ממוצא אירופאי, מחצי האי האיברי בספרד (IBS). החוקרים העריכו את הקשר שבין המוצא לפנוטיפים, וביצענו מחקר GWAS.

שיעורי המוצא הממוצעים עמדו על 84.7% NAT (חולים, 84.2%; ביקורת, 85.4%) ו-15.3% IBSי(15.8%; 14.6%).

לאחר תקנון לאסתמה, גנוטיפ ה-NAT היה קשור לרמות גבוהות יותר של IgE בסרום (P < 0.001) ו-IBS היה קשור לרמות נמוכות יותר של IgE בסרום (P < 0.001). NAT היה קשור לערכים חזויים גבוהים יותר של FEV1 אחוז (P < .001), בעוד ש-IBS היה קשור לערך FEV1 צפוי נמוך יותר בקרב קבוצת הביקורת אך לא בקרב המטופלים.

אזור ה-HLA-DR/DQ בכרומוזום 6 (Chr6) היה קשור מאוד לרמת ה-IgE הכוללת בסרום (rs3135348; P = 3.438 × 10-10) והיה בלתי תלוי בקשר עם ההפלוטיפ HLA-DQA1∼HLA-DQB1:04.01 04.02 (P = 1.55 × 10-05).

בנוסף, מצאו החוקרים וריאנט גנטי שהיה קשור לתפקודי הריאות. החוקרים זיהו לוקוס (rs4410198; P = 5.536 × 10-11) שמופה לכרומוזום 19 (Chr19), שהיה סמוך למקבץ של גנים המקיימים אינטראקציה עם אצבעות אבץ, שממוקם בסביבת רצף הרנ"א הארוך והלא-מקודד CTD-2537I9.5. לוקוס חדש זה שוכפל במדגם בלתי תלוי של ילדים חולי אסתמה מברזיל שעברו אף הם הערכה באמצעות  מזיגה דומה (P = .005).

לסיכום, במחקר הנוכחי אושש התפקיד של HLA באטופיה, וזוהה לוקוס חדש שמופה לרצף רנ"א ארוך שאינו מקודד הקשור לתפקוד הריאות, שעשוי להיות ספציפי לילדים עם NAT.

מקור:

Akenroye, AT et al. The Journal of Allergy and Clinical Immunology. 2021 Dec;148(6):1493-1504.doi: 10.1016/j.jaci.2021.02.035

נושאים קשורים:  מחקרים,  אסתמה,  תפקודי ריאות,  פרופיל גנטי,  דלקת טייפ 2 באסתמה,  type 2
תגובות